/*
 * Michel Héon PhD: Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
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 * 
 * Michel Héon
 * Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
 * 2014
 * Editions ENI 
 * ISBN : 978-2-7460-8869-6
 * EAN : 9782746088696
 * France
 * 
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 */
package com.java_ws.owlapi.exemple;

import org.semanticweb.owlapi.apibinding.OWLManager;
import org.semanticweb.owlapi.model.AddOntologyAnnotation;
import org.semanticweb.owlapi.model.IRI;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLAnnotation;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLAnnotationAssertionAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLAnnotationProperty;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLClass;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLDataFactory;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLDeclarationAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLLiteral;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntology;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyCreationException;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyManager;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyStorageException;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLSubAnnotationPropertyOfAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.vocab.OWLRDFVocabulary;

import com.java_ws.owlapi.exemple.util.JavawsHelper;

/** Auteur: Michel Héon PhD
 
 * Cotechnoe http://www.cotechnoe.com

 * Date: 15-jan-2014
 */
@SuppressWarnings("unused")
public class ChapIX {

    /****************************************************************
     ****************************************************************
     **
     **    Chapitre 9
     **
     ****************************************************************
     ****************************************************************/
    public static void main(String[] args) throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        // Section 2. Annotation d’ontologie
        if (true) annoterOntologie();
        // Section 3. Axiomes d’annotation et assertions
        if (false) annoterUneEntite();
        // Section 4. Recherche d’annotations
        if (false) rechercherLesAnnotations();
        // Section 5. Création d’une propriété d’annotation
        if (false) creerUneAnnotation();
    }
    /****************************************************************
     ****************************************************************
     **
     **    Section 2. Annotation d’ontologie
     **
     ****************************************************************
     ****************************************************************/
    public static void annoterOntologie() throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        OWLOntologyManager manager = OWLManager.createOWLOntologyManager();
        IRI ontologyIRI = IRI.create("http://java-ws.com/ontologies/families");
        OWLOntology ontology = manager.createOntology(ontologyIRI);
        OWLDataFactory factory = manager.getOWLDataFactory();

        // ajouter un commentaire
        OWLLiteral ontoLit = factory.getOWLLiteral("Ontologie de la famille", "fr");
        OWLAnnotation ontoLabel = factory.getOWLAnnotation(
                factory.getOWLAnnotationProperty(OWLRDFVocabulary.RDFS_COMMENT.getIRI()),
                ontoLit);
        manager.applyChange(new AddOntologyAnnotation(ontology, ontoLabel));

        // ajouter une annotation de version
        OWLAnnotation versionAnno = factory.getOWLAnnotation(
                factory.getOWLAnnotationProperty(OWLRDFVocabulary.OWL_VERSION_INFO.getIRI()),
                factory.getOWLLiteral("Version initiale", "fr"));
        manager.applyChange(new AddOntologyAnnotation(ontology, versionAnno));

        // Ajouter une étiquette
        OWLAnnotation labelAnnoFr = factory.getOWLAnnotation(
                factory.getOWLAnnotationProperty(OWLRDFVocabulary.RDFS_LABEL.getIRI()),
                factory.getOWLLiteral("famille", "fr"));
        manager.applyChange(new AddOntologyAnnotation(ontology, labelAnnoFr));
        OWLAnnotation labelAnnoEn = factory.getOWLAnnotation(
                factory.getRDFSLabel(), factory.getOWLLiteral("families", "en"));
        manager.applyChange(new AddOntologyAnnotation(ontology, labelAnnoEn));
        // Indiquer la source de l'information 
        OWLAnnotation isDefinedByAnno = factory.getOWLAnnotation(
                factory.getRDFSIsDefinedBy(), factory.getOWLLiteral("Cotechnoe inc. http://www.cotechnoe.com", "fr"));
        manager.applyChange(new AddOntologyAnnotation(ontology, isDefinedByAnno));

        JavawsHelper.printTurtle(manager, ontology);    
        JavawsHelper.printFunctionalOWL(manager, ontology);    

    }

    /****************************************************************
     ****************************************************************
     **
     **    Section 3. Axiomes d’annotation et assertions
     **
     ****************************************************************
     ****************************************************************/
    public static OWLOntology annoterUneEntite() throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        OWLOntologyManager manager = OWLManager.createOWLOntologyManager();
        IRI ontologyIRI = IRI.create("http://java-ws.com/ontologies/families");
        OWLOntology ontology = manager.createOntology(ontologyIRI);
        OWLDataFactory factory = manager.getOWLDataFactory();
        OWLClass person = factory.getOWLClass(IRI.create(ontologyIRI + "#Person"));
        OWLDeclarationAxiom personAxiom = factory.getOWLDeclarationAxiom(person);
        OWLAnnotation annotationEn = factory.getOWLAnnotation(factory.getRDFSComment(),
                factory.getOWLLiteral("Represents the set of all people", "en"));
        OWLAnnotation annotationFr = factory.getOWLAnnotation(factory.getRDFSComment(),
                factory.getOWLLiteral("Représente l'ensemble de tous les humains", "fr"));
        OWLAnnotation labelAnno = factory.getOWLAnnotation(factory.getRDFSLabel(),
                factory.getOWLLiteral("Personne", "fr"));
        OWLAnnotation seeAlsoFr = factory.getOWLAnnotation(factory.getRDFSSeeAlso(),
                factory.getOWLLiteral("Voir aussi humain", "fr"));
        OWLAnnotationAssertionAxiom annotationAxiomEn = factory.getOWLAnnotationAssertionAxiom(person.getIRI(), annotationEn);
        OWLAnnotationAssertionAxiom annotationAxiomfr = factory.getOWLAnnotationAssertionAxiom(person.getIRI(), annotationFr);
        OWLAnnotationAssertionAxiom labelAxiomfr = factory.getOWLAnnotationAssertionAxiom(person.getIRI(), labelAnno);
        OWLAnnotationAssertionAxiom seeAlsoFrAxiom = factory.getOWLAnnotationAssertionAxiom(person.getIRI(), seeAlsoFr);
        manager.addAxiom(ontology, personAxiom);
        manager.addAxiom(ontology, annotationAxiomEn);
        manager.addAxiom(ontology, annotationAxiomfr);
        manager.addAxiom(ontology, labelAxiomfr);
        manager.addAxiom(ontology, seeAlsoFrAxiom);
        JavawsHelper.printTurtle(manager, ontology);    
        JavawsHelper.printFunctionalOWL(manager, ontology);    
        return ontology;
    }
    
    /****************************************************************
     ****************************************************************
     **
     **    Section 4. Recherche d’annotations
     **
     ****************************************************************
     ****************************************************************/
    public static void rechercherLesAnnotations() throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        OWLOntologyManager manager = OWLManager.createOWLOntologyManager();
        OWLDataFactory factory = manager.getOWLDataFactory();
        OWLOntology ontology = annoterUneEntite();
        OWLAnnotationProperty label = factory.getOWLAnnotationProperty(OWLRDFVocabulary.RDFS_LABEL.getIRI());
        OWLAnnotationProperty comment = factory.getRDFSComment();
        for (OWLClass cls : ontology.getClassesInSignature()) {
            for (OWLAnnotation annotation : cls.getAnnotations(ontology, label)) {
                if (annotation.getValue() instanceof OWLLiteral) {
                    OWLLiteral val = (OWLLiteral) annotation.getValue();
                    if (val.hasLang("fr")) {
                        System.out.println(cls + " -label-> " + val.getLiteral());
                    }
                }
            }
            for (OWLAnnotation annotation : cls.getAnnotations(ontology, comment)) {
                if (annotation.getValue() instanceof OWLLiteral) {
                    OWLLiteral val = (OWLLiteral) annotation.getValue();
                    if (val.hasLang("fr")) {
                        System.out.println(cls + " -comment-> " + val.getLiteral());
                    }
                }
            }
        }
    }
    
    /****************************************************************
     ****************************************************************
     **
     **    Section 5. Création d’une propriété d’annotation
     **
     ****************************************************************
     ****************************************************************/
    public static void creerUneAnnotation() throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        OWLOntologyManager manager = OWLManager.createOWLOntologyManager();
        IRI ontologyIRI = IRI.create("http://java-ws.com/ontologies/families");
        OWLOntology ontology = manager.createOntology(ontologyIRI);
        OWLDataFactory factory = manager.getOWLDataFactory();
        OWLClass person = factory.getOWLClass(IRI.create(ontologyIRI + "#Person"));
        OWLDeclarationAxiom personAxiom = factory.getOWLDeclarationAxiom(person);
        manager.addAxiom(ontology, personAxiom);
        OWLAnnotationProperty name = factory.getOWLAnnotationProperty(IRI.create(ontologyIRI + "#name"));
        OWLAnnotation namePersonne = factory.getOWLAnnotation(name,    factory.getOWLLiteral("Personne", "fr"));
        OWLSubAnnotationPropertyOfAxiom nameProp = factory.getOWLSubAnnotationPropertyOfAxiom(name, factory.getRDFSLabel());
        OWLAnnotationAssertionAxiom annotationAxiomFr = factory.getOWLAnnotationAssertionAxiom(person.getIRI(), namePersonne);
        manager.addAxiom(ontology, annotationAxiomFr);
        manager.addAxiom(ontology, nameProp);

        JavawsHelper.printTurtle(manager, ontology);    
        JavawsHelper.printFunctionalOWL(manager, ontology);    

    }

}